Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms