Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsrp1Q3UC65 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsrp1Q3UC65 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms