Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms