Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms