Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21440Q3TTD8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21440Q3TTD8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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