Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stt3bQ3TDQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stt3bQ3TDQ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stt3bQ3TDQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stt3bQ3TDQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stt3bQ3TDQ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stt3bQ3TDQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms