Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem248Q3TBN1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms