Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prr27Q3SYJ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prr27Q3SYJ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prr27Q3SYJ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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