Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms