Protein–RNA interactions for Protein: Q3LS21

Kcnk9, Potassium channel subfamily K member 9, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk9Q3LS21 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnk9Q3LS21 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms