Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Defb33Q30KN3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Defb33Q30KN3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb33Q30KN3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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