Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms