Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms