Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms