Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms