Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms