Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms