Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms