Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms