Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms