Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms