Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top2aQ01320 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms