Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelpQ01102 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms