Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms