Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms