Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ElocP83940 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElocP83940 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElocP83940 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElocP83940 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms