Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms