Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx3P81067 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms