Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx2P81066 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms