Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cct5P80316 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cct5P80316 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cct5P80316 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cct5P80316 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cct5P80316 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms