Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms