Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms