Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf3P70671 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf3P70671 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms