Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms