Protein–RNA interactions for Protein: P70451

Fer, Tyrosine-protein kinase Fer, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FerP70451 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FerP70451 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FerP70451 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FerP70451 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FerP70451 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FerP70451 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FerP70451 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms