Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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