Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad50P70388 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms