Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ufd1P70362 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms