Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp3P70281 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms