Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UbdP63072 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UbdP63072 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UbdP63072 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UbdP63072 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UbdP63072 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms