Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms