Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpfP62307 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms