Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps11P62281 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms