Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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