Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vbp1P61759 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vbp1P61759 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms