Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms