Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2iP60898 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms