Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn18P56857 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn18P56857 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn18P56857 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn18P56857 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn18P56857 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn18P56857 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn18P56857 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn18P56857 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn18P56857 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn18P56857 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn18P56857 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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