Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms