Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms